Дирекция „Конфликт на интереси“ извършва проверки за установяване наличието или липсата на конфликт на интереси по отношение на лицата по чл. 6, ал. 1 от Закона за противодействие на корупцията и за отнемане на незаконно придобитото иущество (ЗПКОНПИ), въз основа на сигнал, подаден до Комисията, по решение на Комисията или по постъпило искане на лицето, заемащо висша публична длъжност. В хода на проверките по образувани производства за конфликт на интереси се изисква и получава необходимата информация и документи от комисиите по чл. 72, ал. 2, т. 1 и 3 от ЗПКОНПИ, съответно от органа по избора или назначаването, органите на държавната власт, органите на местното самоуправление, както и от юридически и физически лица. Извършват се справки чрез пряк достъп до електронните регистри, база данни и други информационни масиви, поддържани от други държавни органи, с изключение на службите за сигурност. При наличие на данни за извършено престъпление, дирекцията прави предложение до Комисията за подготовка и изпращане на материалите незабавно на прокуратурата.
Дирекция „Конфликт на интереси“ изготвя проекти на решения, заедно с мотивите към тях, за образуване на производство за конфликт на интереси или за липса на основание за образуване на производство; решения за установяване на конфликт на интереси, както и за нарушения по чл. 68 и 69 от ЗПКОНПИ и налагане на глоба по чл. 171 от ЗПКОНПИ и определяне на нейния размер, както и за отнемане по реда на чл. 81 от закона; решения за неустановяване на конфликт на интереси; решения за удължаване срока на производството на основание чл. 74, ал. 1 от закона; решения за прекратяване на образуваното производство, както и други решения по реда на Административнопроцесуалния кодекс (АПК).
Задължение на дирекция „Конфликт на интереси“ е и изготвянето на проекти на писма за съобщаване на приетото от Комисията решение на лицата по чл.75 от ЗПКОНПИ, а имено: заинтересованото лице; органа, компетентен да прекрати правоотношението; окръжната прокуратура по седалището на органа, компетентен да прекрати правоотношението.
Служители от дирекция „Конфликт на интереси“ осъществяват процесуално представителство на Комисията и на нейния председател по образувани дела по производства за конфликт на интереси.
След влизане в сила на решение на Комисията, с което е установен конфликт на интереси, дирекцията има задъжението да изготви доклад до Комисията с приложен проект на решение за започване на проверка за незаконно придобито имущество, във вр. с чл. 108, ал. 5 от ЗПКОНПИ, поради установен с влязъл в сила акт конфликт на интереси.
